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武漢電泳設備中電泳出現拖尾現象,英文成為smear,就是彌散。其原因,主要從以下兩個方面考慮:
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1、PCR產物自身原因:
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往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,
退火溫度過低,循環(huán)次數過多,而造成PCR的非特異性產物過多。
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對策:
①減少Taq酶的量,或調換另一來源的酶。
②減少dNTP的濃度。
③適當降低Mg2+濃度。
④增加模板量,減少引物的用量,減少循環(huán)次數,提高退火溫度。
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2、電泳體系的問題:
(1)電泳緩沖液TAE或者TBE的污染,建議更換緩沖液。
(2)上樣時樣品漂了,建議增加上樣緩沖液的用量,以及小心加樣。
(3)電壓太高。
(4)適當把你的膠的濃度加大。(根據你的片斷大小而定)
(5)觀察你的marker是否也存在拖尾現象,作為對照。
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PCR拖尾及假陽性的原因及對策
拖尾現象:產物在凝膠上呈Smear狀態(tài)。
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原因:
1.模板不純
2.Buffer不合適
3.退火溫度偏低
4.酶量過多
5.dNTP、Mg2+濃度偏高
6.循環(huán)次數過多
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對策:
1.純化模板
2.更換Buffer
3.適當提高退火溫度
4.適量用酶
5.適當降低dNTP和鎂離子的濃度
6.減少循環(huán)次數
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假陽性
現象:空白對照出現目的擴增產物
原因:
靶序列或擴增產物的交叉污染
對策:
1.操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內或濺出離心管外;
2.除酶及不能耐高溫的物質外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及加樣槍頭等均應一次性使用。
3.各種試劑最好先進行分裝,然后低溫貯存
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武漢電泳設備運行中出現的問題要及時應對,有因有果,找對方法一定可以很好解決電泳設備中電泳出現拖尾現象!